音楽の時間に習った童謡が気に入ったまる子は、図工でその絵を描くことに。だけどある日、仲良くなった似顔絵描きのお姉さんが、これは実は悲しい歌なのだと教えてくれて...。
我が道を行く少年、大黒天ベルは世界中の配信を乗っ取って、すべてのブレーダーにちょうせん状をたたきつける。ベルが作り出したダイナマイトバトルシステムで、激しい戦いが始まる!
のび太が見つけた化石から、なんと双子の恐竜の赤ちゃんが誕生。すくすく大きくなる2匹を元の時代に返すため、のび太は仲間たちと一緒に6600万年前へと出発。恐竜世界で大冒険が始まる!
月へやってきたのび太たちは、そこに隠れ住むエスパルという不思議な力を持つ種族と仲良くなる。ところが、謎の宇宙船にエスパルたちがさらわれてしまい...。
太平洋上に突然現れた謎の島に眠る秘宝を探しに、船で大海原へ繰り出したのび太たち。ところが、もう少しで島に上陸というところで海賊に襲われてしまう。