世界中で大ブームのダイブ型VRMMO、Infinite Dendrogram。現実との区別がつかないほどリアルな仮想世界で、1人の青年が無限の可能性に満ちた冒険の扉を開ける。
バラバラ殺人事件の被害者は、いつも無邪気な"チワワちゃん"だった。遊び仲間たちはチワワの思い出を語るが、それぞれの記憶の中の彼女の姿は全く異なっていた。
魔法によって頭をハ虫類に変えられ、記憶を失った男カイマンは、自分の本当の顔と記憶を取り戻すため、友人のニカイドウとともに"ホール"で魔法使いを狩り続ける。
低身長の藤戸千雪の夢は、パリコレモデル。家族を支える都村育人の夢は、ファッションデザイナー。2人は厳しい現実に負けることなく、夢を追って共に走り出す。
願いを何でもかなえてくれるという女子トイレの幽霊、花子さん。少女が恋愛成就のために花子さんを呼び出してみると...現れたのは男の子の幽霊"花子くん"だった!